Родился 15 февраля 1962 года в Эстонии. Руководитель Городского театра Таллинна. Известен масштабными постановками классики: «Ромео и Джульетта», «Гамлет» У. Шекспира, «Три мушкетера» и «Мушкетеры двадцать лет спустя» по А. Дюма, «Пианола, или Механическое пианино» А. Чехова, «Преступление и наказание» Ф. Достоевского. Снимается в кино. Среди последних работ - роли в кинофильмах "Только воскресенье", "Серый свет ноября", "Любовь к трем апельсинам", "Мандарины". Кроме того, Нюганен снял по собственному сценарию один из самых популярных в Эстонии фильмов  "Имена на мраморной доске". Другая его лента - "1944" - выдвигалась на премию "Оскар" в номинации "Лучший фильм на иностранном языке", а также получила две премии на российском фестивале "Киношок".

В БДТ им. Товстоногова поставил «Аркадию» Т. Стоппарда и "Томление" (пьеса У. Бойда по мотивам рассказов Чехова). Играет в спектакле "451 по Фаренгейту" московского театра Et cetera.

В "Ленкоме" поставил комедию "Tout paye, или Все оплачено" И. Жамиака

Лауреат Государственной премии России